Pesantren PAQUSATTA memiliki kurikulum pendidikan dalam mata pelajaran agama Islam seperti: Akidah, Tafsir, Bhs Arab, Fikih, Hadits, Sirah Nabawiyah, dan pelajaran lain. Sedangkan kurikulum pendidikan umum mencakup: Matematika, Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris, dan pelajaran lain.
Pendidikan Islam di PAQUSATTA mengacu kepada kitab-kitab tradisional (Kitab Kuning) yang telah banyak digunakan oleh pesantren-pesantren di Indonesia selama puluhan atau bahkan ratusan tahun.



