Pesantren PAQUSATTA memiliki agenda pembinaan kesantrian yang didesain untuk membentuk akhlak atau adab Islami dari para santri-santriwati. Agenda pembinaan itu mencakup: Sholat Berjamaah, Sholat Malam, Puasa Sunnah, Dzikir Pagi dan Petang, Kerja Bakti, dll.
Tahfidzul Qur’an juga merupakan agenda pembinaan penting bagi santri-santriwati, untuk mendidik akhlak mulia berbasis Al-Qur’an. Para santri-santriwati diberikan target untuk minimal hafal 6 juz selama mereka belajar di Pesantren Paqusatta.
Pramuka dan Bela Diri adalah program ekstra kurikuler wajib bagi santri-santriwati, yang dengannya diharapkan mereka memiliki kedisiplinan diri dan akhlak yang mulia.
Agenda pembinaan lain meliputi ketrampilan hidup seperti: memasak, berkebun, beternak, pertukangan, kerajinan tangan, desain grafis, dll.
Pesantren Al-Qur'an Sangatta Taqwa 